Après l'adoption de la loi Guizot sur l'enseignement en 1833, le registre des délibérations du Conseil municipal de Savigné-sur-Lathan indique que la commune rétribue un instituteur pour l'instruction de 10 enfants accueillis à titre gratuit.

La construction d'une mairie-école abritant une classe unique est décidée. Elle sera implantée à l'emplacement de l'ancien cimetière du bourg en 1843. Dès 1845, une cloison d'un mètre vingt de haut est installée dans la salle de classe afin de séparer garçons et filles.

En 1854, on instaure une distribution de prix aux élèves méritants.

En 1858, les élus s'opposent à la création d'une école spéciale pour les filles. L'Inspecteur d'académie note que le Conseil municipal, « sous l'influence d'une fâcheuse machination, a refusé de voter les fonds nécessaires. »

Néanmoins une école de filles dirigées par des religieuses fonctionne à Savigné-sur-Lathan en 1860, qui sera transformée en école communale dès 1864. En 1873, elle est dirigée par des religieuses de la Congrégation des sœurs de la Providence de la Pommeraye mais il semble qu'en 1876 elles soient remplacées par une institutrice laïque. En 1878, la commune engage une procédure judiciaire à leur encontre, les accusant d'avoir emporté le mobilier de l'école communale pour créer une école libre.

La municipalité fait édifier un nouveau bâtiment pour école des filles, inauguré en 1882. L'école libre tenue par les religieuses est fermée en 1902. Ses 25 élèves sont désormais accueillies à l'école communale de filles, qui comptait déjà 44 élèves.

En 1910, une deuxième classe est créée à l'école des garçons.

A partir de 1912, une section enfantine est créée à l'école des filles. La classe de maternelle est inaugurée en 1914.

Durant la Première Guerre mondiale, l'école des filles accueille 14 réfugiées. La commune recense 17 enfants orphelins durant la guerre.

En 1953, les deux écoles sont composées de deux classes chacune et accueillent au total près de 140 élèves.

La construction du collège en 1960 allège probablement les effectifs de l'école par le transfert des cours complémentaires.

En 1974, la municipalité fait construire 5 classes pour l'école élémentaire. En 1986, le groupe scolaire est composé de 8 classes mais ses effectifs seront désormais à la baisse. En 2008, l'école primaire accueille 171 élèves dans 7 classes, puis 111 élèves dans 5 classes en 2018. En 2022, les effectifs semblent stabilisés avec 115 élèves répartis en 5 classes.

Archives prises dans l'établissement le 27 juin 2022.

Les articles 2951W4 à 2951W15 étaient précédemment cotés T1044 et T1045, dans la série moderne des Archives départementales d'Indre-et-Loire.

Aux Archives départementales :

- T 1123 : cote provisoire, écoles primaires, classement par commune

- 2O/241 : cote provisoire, Fonds de la préfecture, Service de l'administration communale

- 953W54, 1007W168 : fonds du patrimoine immobilier départemental, bâtiments de l'enseignement

- 2738W570 : fonds de l'Université de Tours, CESA-Polytech, mémoires des étudiants

- Edep241/R1-12 : fonds de la commune, enseignement-œuvres périscolaires

- 80W13 : fonds de l'école primaire de Savigné-sur-Lathan, cahiers d'écoliers.